MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidothermus cellulolyticus 11B chromosome

Total Repeats: 58113

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008578	TC	3	6	155	160	0 %	50 %	0 %	50 %	117927212
2	NC_008578	C	6	6	160	165	0 %	0 %	0 %	100 %	117927212
3	NC_008578	CCG	2	6	217	222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927212
4	NC_008578	CA	3	6	235	240	50 %	0 %	0 %	50 %	117927212
5	NC_008578	GAAG	2	8	248	255	50 %	0 %	50 %	0 %	117927212
6	NC_008578	CCGG	2	8	272	279	0 %	0 %	50 %	50 %	117927212
7	NC_008578	CGC	2	6	287	292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927212
8	NC_008578	GCCG	2	8	306	313	0 %	0 %	50 %	50 %	117927212
9	NC_008578	CCA	2	6	373	378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117927212
10	NC_008578	GCG	2	6	470	475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927212
11	NC_008578	AGCA	2	8	533	540	50 %	0 %	25 %	25 %	117927212
12	NC_008578	GCC	2	6	555	560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927212
13	NC_008578	GCC	3	9	567	575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927212
14	NC_008578	TCA	2	6	730	735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117927212
15	NC_008578	CCG	2	6	767	772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927212
16	NC_008578	GACGTC	2	12	783	794	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	117927212
17	NC_008578	CGA	2	6	803	808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927212
18	NC_008578	CAA	2	6	881	886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117927212
19	NC_008578	AAC	2	6	919	924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117927212
20	NC_008578	TCA	2	6	970	975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117927212
21	NC_008578	ACC	2	6	986	991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117927212
22	NC_008578	TCC	2	6	1015	1020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117927212
23	NC_008578	AAG	2	6	1023	1028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117927212
24	NC_008578	GCG	2	6	1029	1034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927212
25	NC_008578	AAG	2	6	1036	1041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117927212
26	NC_008578	GC	3	6	1114	1119	0 %	0 %	50 %	50 %	117927212
27	NC_008578	GGT	2	6	1181	1186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117927212
28	NC_008578	TCA	2	6	1237	1242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117927212
29	NC_008578	CTGA	2	8	1353	1360	25 %	25 %	25 %	25 %	117927212
30	NC_008578	ACG	2	6	1407	1412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927212
31	NC_008578	TCGA	2	8	1457	1464	25 %	25 %	25 %	25 %	117927212
32	NC_008578	GAT	2	6	1513	1518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117927212
33	NC_008578	CGTC	2	8	1990	1997	0 %	25 %	25 %	50 %	117927213
34	NC_008578	GACGG	2	10	2106	2115	20 %	0 %	60 %	20 %	117927213
35	NC_008578	TGC	2	6	2240	2245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927213
36	NC_008578	GAG	2	6	2251	2256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117927213
37	NC_008578	GCC	2	6	2268	2273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927213
38	NC_008578	GTG	2	6	2335	2340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117927213
39	NC_008578	CGA	2	6	2352	2357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927213
40	NC_008578	TGA	2	6	2405	2410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117927213
41	NC_008578	GGC	2	6	2415	2420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927213
42	NC_008578	CGG	2	6	2486	2491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927213
43	NC_008578	GC	3	6	2503	2508	0 %	0 %	50 %	50 %	117927213
44	NC_008578	GAC	2	6	2535	2540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927213
45	NC_008578	ACG	3	9	2635	2643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927213
46	NC_008578	CGG	2	6	2687	2692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927213
47	NC_008578	CGC	2	6	2743	2748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927213
48	NC_008578	CG	3	6	2859	2864	0 %	0 %	50 %	50 %	117927213
49	NC_008578	AGC	2	6	2872	2877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927213
50	NC_008578	GAC	3	9	2952	2960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927213
51	NC_008578	TCACC	2	10	2969	2978	20 %	20 %	0 %	60 %	117927213
52	NC_008578	CAA	2	6	2979	2984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117927213
53	NC_008578	CGG	2	6	2987	2992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927213
54	NC_008578	CGA	2	6	3039	3044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927213
55	NC_008578	GGC	2	6	3076	3081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927213
56	NC_008578	CGCGC	2	10	3142	3151	0 %	0 %	40 %	60 %	117927214
57	NC_008578	TCG	2	6	3179	3184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927214
58	NC_008578	GGGCA	2	10	3193	3202	20 %	0 %	60 %	20 %	117927214
59	NC_008578	TCG	2	6	3212	3217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927214
60	NC_008578	CGAC	2	8	3260	3267	25 %	0 %	25 %	50 %	117927214
61	NC_008578	GGCAG	2	10	3281	3290	20 %	0 %	60 %	20 %	117927214
62	NC_008578	GCC	2	6	3329	3334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927214
63	NC_008578	CGC	2	6	3403	3408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927214
64	NC_008578	GTC	2	6	3436	3441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927214
65	NC_008578	GGA	2	6	3453	3458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117927214
66	NC_008578	GAT	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117927214
67	NC_008578	CCGT	2	8	3542	3549	0 %	25 %	25 %	50 %	117927214
68	NC_008578	TTC	2	6	3587	3592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117927214
69	NC_008578	CAG	2	6	3613	3618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927214
70	NC_008578	GCGG	2	8	3660	3667	0 %	0 %	75 %	25 %	117927214
71	NC_008578	ACG	3	9	3687	3695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927214
72	NC_008578	TCG	2	6	3719	3724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927214
73	NC_008578	CGC	2	6	3735	3740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927214
74	NC_008578	GGC	2	6	3748	3753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927214
75	NC_008578	GAA	2	6	3793	3798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117927214
76	NC_008578	CGA	2	6	3813	3818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927214
77	NC_008578	CGC	2	6	3843	3848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927214
78	NC_008578	TCG	2	6	3893	3898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927214
79	NC_008578	GAT	2	6	3910	3915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117927214
80	NC_008578	GCC	2	6	3935	3940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927214
81	NC_008578	GCCA	2	8	3955	3962	25 %	0 %	25 %	50 %	117927214
82	NC_008578	GCT	2	6	4011	4016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927214
83	NC_008578	TGA	2	6	4040	4045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117927214
84	NC_008578	GAC	2	6	4051	4056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927214
85	NC_008578	CAG	2	6	4075	4080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927214
86	NC_008578	CGCAGG	2	12	4081	4092	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	117927214
87	NC_008578	TCA	2	6	4127	4132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117927214
88	NC_008578	CGT	2	6	4176	4181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927214
89	NC_008578	GGC	2	6	4258	4263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927215
90	NC_008578	CGG	2	6	4289	4294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927215
91	NC_008578	GCC	2	6	4303	4308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927215
92	NC_008578	CGC	2	6	4322	4327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927215
93	NC_008578	CTT	2	6	4358	4363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117927215
94	NC_008578	GGCT	2	8	4397	4404	0 %	25 %	50 %	25 %	117927215
95	NC_008578	ATC	2	6	4448	4453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117927215
96	NC_008578	GCCG	2	8	4476	4483	0 %	0 %	50 %	50 %	117927215
97	NC_008578	CTT	2	6	4550	4555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117927215
98	NC_008578	AGG	2	6	4581	4586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117927215
99	NC_008578	CCG	2	6	4587	4592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927215
100	NC_008578	GACC	2	8	4623	4630	25 %	0 %	25 %	50 %	117927215
101	NC_008578	TG	3	6	4941	4946	0 %	50 %	50 %	0 %	117927216
102	NC_008578	CTCG	2	8	4961	4968	0 %	25 %	25 %	50 %	117927216
103	NC_008578	AGT	2	6	4974	4979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117927216
104	NC_008578	ACG	2	6	4981	4986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927216
105	NC_008578	CAC	2	6	5073	5078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117927216
106	NC_008578	GGT	2	6	5090	5095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117927216
107	NC_008578	CGA	2	6	5108	5113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927216
108	NC_008578	CGG	2	6	5162	5167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927216
109	NC_008578	CGA	2	6	5204	5209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927216
110	NC_008578	CGG	2	6	5230	5235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927216
111	NC_008578	GGC	2	6	5277	5282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927216
112	NC_008578	CGGCGT	2	12	5312	5323	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	117927216
113	NC_008578	CGT	2	6	5327	5332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927216
114	NC_008578	GGC	2	6	5386	5391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927216
115	NC_008578	CCG	2	6	5399	5404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927216
116	NC_008578	CCGA	2	8	5439	5446	25 %	0 %	25 %	50 %	117927216
117	NC_008578	CCGGA	2	10	5447	5456	20 %	0 %	40 %	40 %	117927216
118	NC_008578	ACG	2	6	5457	5462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927216
119	NC_008578	GAC	2	6	5495	5500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927216
120	NC_008578	CCG	2	6	5590	5595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927216
121	NC_008578	CGA	2	6	5609	5614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927216
122	NC_008578	GCCG	2	8	5624	5631	0 %	0 %	50 %	50 %	117927216
123	NC_008578	GCG	2	6	5632	5637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927216
124	NC_008578	CGACC	2	10	5639	5648	20 %	0 %	20 %	60 %	117927216
125	NC_008578	TTA	2	6	5654	5659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117927216
126	NC_008578	ACG	2	6	5665	5670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927216
127	NC_008578	TGG	2	6	5677	5682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117927216
128	NC_008578	GCA	2	6	5725	5730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927216
129	NC_008578	GCAC	2	8	5854	5861	25 %	0 %	25 %	50 %	117927216
130	NC_008578	TGC	2	6	5876	5881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927216
131	NC_008578	GAG	2	6	5910	5915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117927216
132	NC_008578	TCA	2	6	5923	5928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117927216
133	NC_008578	AGGG	2	8	5964	5971	25 %	0 %	75 %	0 %	117927216
134	NC_008578	TCGT	2	8	6057	6064	0 %	50 %	25 %	25 %	117927216
135	NC_008578	GAA	2	6	6104	6109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117927216
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249	NC_008578	CAA	2	6	10962	10967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117927219
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258	NC_008578	GGC	2	6	11372	11377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927220
259	NC_008578	TTGC	2	8	11395	11402	0 %	50 %	25 %	25 %	117927220
260	NC_008578	CAAT	2	8	11444	11451	50 %	25 %	0 %	25 %	117927220
261	NC_008578	GGC	2	6	11454	11459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927220
262	NC_008578	CTG	2	6	11485	11490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927220
263	NC_008578	GCC	2	6	11503	11508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927220
264	NC_008578	GTT	2	6	11565	11570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117927220
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271	NC_008578	CGG	2	6	11959	11964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927221
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284	NC_008578	GCTG	2	8	12577	12584	0 %	25 %	50 %	25 %	117927222
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